More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3561 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 907 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 908 aa  1797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 912 aa  204  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  29.16 
 
 		 893 aa  198  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 910 aa  144  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 926 aa  129  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  27.05 
 
 		 845 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 894 aa  111  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 868 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 879 aa  99  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 880 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.35 
 
 		 903 aa  91.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 871 aa  88.6  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  27.15 
 
 		 867 aa  87.8  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.38 
 
 		 864 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  26.74 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  27.7 
 
 		 865 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  26.38 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  24.7 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 895 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  49.35 
 
 		 928 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 224 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.63 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  50.79 
 
 		 955 aa  60.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  55.36 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  52.73 
 
 		 1001 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  54.9 
 
 		 934 aa  58.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.08 
 
 		 876 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 943 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  26.15 
 
 		 292 aa  57  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 938 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 916 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 923 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 876 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 228 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 919 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  55.77 
 
 		 884 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 226 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 941 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.84 
 
 		 928 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 228 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 879 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 910 aa  54.7  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 214 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 940 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.83 
 
 		 929 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  50.98 
 
 		 961 aa  54.7  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 213 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 931 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 469 aa  54.7  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 211 aa  54.3  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 953 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 946 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 1000 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 889 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.21 
 
 		 938 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 950 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  58.33 
 
 		 884 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  45.28 
 
 		 231 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 228 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  45.07 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.46 
 
 		 923 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.08 
 
 		 224 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.08 
 
 		 224 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 909 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  53.5  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  47.14 
 
 		 892 aa  53.5  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 951 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 211 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 956 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 919 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 924 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 959 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 119 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  24.51 
 
 		 335 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.24 
 
 		 913 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 216 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 189 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 904 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 218 aa  52.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 230 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  47.06 
 
 		 824 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 928 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 222 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 218 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 865 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  45.1 
 
 		 925 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3972  two component LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 251 aa  52  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 908 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 918 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 1089 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 363 aa  52  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>