More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3558 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
334 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.23 
 
 
354 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  59.74 
 
 
319 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.92 
 
 
327 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.14 
 
 
332 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.31 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.78 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.77 
 
 
325 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 
326 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
333 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  45.13 
 
 
327 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
321 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.61 
 
 
321 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.57 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.21 
 
 
321 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.53 
 
 
321 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
321 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.21 
 
 
321 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
321 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  42.3 
 
 
321 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.3 
 
 
321 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.3 
 
 
321 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.3 
 
 
321 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  42.3 
 
 
321 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
329 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.15 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
327 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
321 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
314 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
316 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
333 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
343 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.01 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  35.37 
 
 
325 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
318 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
317 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
346 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
346 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  35.85 
 
 
326 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
313 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
323 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
318 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
313 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  35.51 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  35.51 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
313 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
318 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
311 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.81 
 
 
311 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 
314 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
340 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
340 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
336 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
313 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
330 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
311 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
308 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
312 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
341 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 
325 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
356 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.64 
 
 
314 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.62 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.64 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
322 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.29 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.29 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  39.62 
 
 
326 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
345 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
345 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
365 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
322 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
333 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
308 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
333 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
316 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
310 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.27 
 
 
345 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
330 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
318 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
320 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>