More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3468 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  100 
 
 
468 aa  920    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  62.83 
 
 
457 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  41.03 
 
 
446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  35.85 
 
 
464 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  36.3 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  36.72 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  35.7 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  36.04 
 
 
452 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  35.81 
 
 
452 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  35.59 
 
 
452 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  33.56 
 
 
453 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  34.39 
 
 
457 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  36.38 
 
 
458 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  34.64 
 
 
452 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  35.1 
 
 
480 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  36.55 
 
 
443 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  36.64 
 
 
442 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
460 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
443 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
443 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  36.41 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  36.95 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  31.37 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  31.37 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  31.37 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  31.37 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  31.37 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  34.7 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  34.02 
 
 
445 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  34.02 
 
 
445 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  34.02 
 
 
445 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  34.02 
 
 
445 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
445 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  34.02 
 
 
445 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
469 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
423 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.07 
 
 
476 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  27.94 
 
 
434 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
451 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  26.54 
 
 
447 aa  147  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
465 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
465 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  26.21 
 
 
459 aa  143  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  28.6 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.93 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  28.57 
 
 
480 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.19 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  26.97 
 
 
467 aa  134  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.36 
 
 
474 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.49 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.97 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.24 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03836  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
547 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.8 
 
 
474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.28 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  26.3 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.33 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  28.21 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 
472 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  27.21 
 
 
459 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.7 
 
 
474 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.7 
 
 
477 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  26.38 
 
 
482 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  26.84 
 
 
480 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.39 
 
 
471 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  28.26 
 
 
441 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.82 
 
 
457 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 
450 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  27.85 
 
 
469 aa  123  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  28.32 
 
 
499 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.11 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
459 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  29.23 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.88 
 
 
478 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.37 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  25.43 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  27.43 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.14 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  27.19 
 
 
509 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.59 
 
 
456 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.49 
 
 
473 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.13 
 
 
463 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  25.43 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>