60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3416 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
109 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  70.83 
 
 
203 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  62.96 
 
 
233 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  60 
 
 
208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  60 
 
 
208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  53.77 
 
 
204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  53.77 
 
 
204 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  59.38 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  60.64 
 
 
212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  54.29 
 
 
204 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  54.72 
 
 
204 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  53.85 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  59.57 
 
 
222 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  59.57 
 
 
222 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  56.25 
 
 
215 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  55.32 
 
 
202 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  45.79 
 
 
215 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  48.94 
 
 
233 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  48.42 
 
 
210 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  48.96 
 
 
235 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  52.58 
 
 
202 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  43.52 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 
212 aa  91.3  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  46.08 
 
 
210 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  45.71 
 
 
257 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  51.55 
 
 
202 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  46.73 
 
 
217 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  46.46 
 
 
237 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  43.16 
 
 
234 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  44.76 
 
 
217 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  47.42 
 
 
202 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  49.33 
 
 
202 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  55.41 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  43.4 
 
 
211 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  51.55 
 
 
200 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  50.52 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  43.75 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  46.85 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  46.39 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  48.42 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  44.76 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  46.32 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  44.33 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  46.32 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  43.16 
 
 
201 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  45.21 
 
 
211 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  44.21 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  38.83 
 
 
208 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  45.83 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  51.04 
 
 
237 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  43.84 
 
 
211 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  49.3 
 
 
209 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  45.83 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  32.29 
 
 
217 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  34.74 
 
 
215 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  35.29 
 
 
215 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  27.78 
 
 
191 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>