31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3413 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  58.63 
 
 		 1065 aa  720    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  65 
 
 		 1880 aa  830    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  54.74 
 
 		 914 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  81.15 
 
 		 677 aa  1118    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  54.15 
 
 		 743 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  58.51 
 
 		 787 aa  730    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  52.89 
 
 		 618 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  50.53 
 
 		 773 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.57 
 
 		 833 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  53.33 
 
 		 676 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 672 aa  1370    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  54.74 
 
 		 820 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  51.82 
 
 		 744 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  49.43 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  48.62 
 
 		 1266 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  50.41 
 
 		 746 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  48.14 
 
 		 613 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.93 
 
 		 774 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  44.46 
 
 		 658 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  44.13 
 
 		 616 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  52.07 
 
 		 669 aa  492  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.69 
 
 		 848 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  35.8 
 
 		 851 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  45.67 
 
 		 1082 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  45.63 
 
 		 767 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  39.66 
 
 		 803 aa  278  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  45.04 
 
 		 240 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  29.43 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  22.01 
 
 		 695 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  22.43 
 
 		 667 aa  48.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  33.75 
 
 		 2474 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>