More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3234 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 400 aa  809    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  61.18 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  61.54 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  55.53 
 
 		 398 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  55.27 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  57.07 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  55.33 
 
 		 410 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  55.08 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  55.38 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  49.34 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  52.12 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  49.36 
 
 		 407 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  48.74 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  50.63 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  50.26 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  50.26 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  50 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  49.24 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  49.62 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  50.13 
 
 		 422 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  49.34 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  49.6 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  49.6 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  49.6 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  50.77 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  49.87 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  49.34 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  49.34 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  50.26 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  50.52 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  50 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  50.26 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  49.74 
 
 		 422 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  50.26 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  49.34 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  49.74 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  44.73 
 
 		 402 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  44.47 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 407 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  43.12 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  42.16 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  43.44 
 
 		 404 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.54 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  43.36 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  45.62 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  42.97 
 
 		 625 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  42.69 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.26 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  44.87 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.98 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  44.01 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 398 aa  299  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  43.08 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  46.39 
 
 		 408 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  57.56 
 
 		 245 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  44.24 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  35.68 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.02 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 373 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 373 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 373 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 373 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.58 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 367 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>