More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3187 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 438 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  91.1 
 
 		 446 aa  779    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.4 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.9 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.28 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.59 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.15 
 
 		 420 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.32 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.24 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.81 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.06 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.23 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.81 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.32 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.14 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.37 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.32 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.86 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.27 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.94 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.02 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.65 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.65 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.06 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.07 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.01 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.09 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.67 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.9 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.7 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.61 
 
 		 411 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.9 
 
 		 704 aa  373  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 422 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.53 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.9 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 424 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.84 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.72 
 
 		 414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.55 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 422 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.95 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.85 
 
 		 433 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 429 aa  348  9e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.32 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.86 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.76 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.34 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 		 427 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.99 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 425 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.48 
 
 		 430 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 426 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>