251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3169 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  93.03 
 
 
445 aa  853    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
445 aa  909    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  50.82 
 
 
446 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  47.17 
 
 
432 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  46.31 
 
 
445 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  39.46 
 
 
438 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  39.86 
 
 
427 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  35.98 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  35.34 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 
408 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  31.13 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  31.06 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  31.06 
 
 
399 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 
424 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 
408 aa  170  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
421 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 
417 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
417 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
420 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
419 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
420 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
419 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.07 
 
 
380 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
420 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 
414 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
434 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
631 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 
495 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.54 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  24.87 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.08 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  27.87 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.78 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
544 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  25.55 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
424 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.67 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
424 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  34.25 
 
 
450 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
441 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  25.74 
 
 
457 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
451 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 
435 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
434 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  21.32 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
419 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 
447 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
460 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  25.7 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.28 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>