More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2986 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  58.26 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.81 
 
 		 327 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  54.69 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  52.76 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.29 
 
 		 368 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  56.03 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  53.04 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  54.64 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  50.86 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  47.5 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 370 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.83 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  44 
 
 		 1048 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.93 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.6 
 
 		 388 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.94 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.94 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.13 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.13 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 524 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.13 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50 
 
 		 265 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 307 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 295 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 335 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  44 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  46 
 
 		 284 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42 
 
 		 267 aa  88.6  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  44 
 
 		 269 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 391 aa  88.2  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 264 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44 
 
 		 266 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 319 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 532 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  51.14 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.46 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 535 aa  85.9  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 278 aa  85.5  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.64 
 
 		 556 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  56.63 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  38.98 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.29 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.39 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  38.98 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  47 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 536 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.62 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.36 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  35.66 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 532 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.81 
 
 		 370 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  47.19 
 
 		 384 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  35.16 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  48.81 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>