More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2889 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
123 aa  246  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  64.6 
 
 
123 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  69.57 
 
 
119 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  65.77 
 
 
131 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  59.83 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  62.16 
 
 
120 aa  150  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 
122 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  52.63 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 
123 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 
126 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
126 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
126 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
126 aa  120  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
126 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 
126 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  51.33 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  45.13 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  48.78 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  39.66 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 
122 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 
122 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  57.14 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  43.36 
 
 
119 aa  103  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 
141 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  47.22 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  32.73 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  37.23 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.84 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  33.72 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 
242 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  32.67 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  29.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
123 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  36.36 
 
 
235 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  27.52 
 
 
123 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
115 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 
123 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
256 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
258 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
256 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>