More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2880 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  86.11 
 
 
181 aa  320  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  69.66 
 
 
182 aa  255  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  69.1 
 
 
182 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  62.21 
 
 
190 aa  225  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  56.5 
 
 
181 aa  206  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  57.56 
 
 
183 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  56.5 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  53.11 
 
 
181 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  54.49 
 
 
183 aa  194  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  55.88 
 
 
176 aa  191  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  51.76 
 
 
183 aa  187  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  52.3 
 
 
219 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  48.85 
 
 
178 aa  184  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  52.6 
 
 
183 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  50.28 
 
 
186 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  47.73 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  50.88 
 
 
181 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  48.84 
 
 
181 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  50.3 
 
 
185 aa  174  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  52.35 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  51.74 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  47.22 
 
 
196 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  49.12 
 
 
183 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  49.71 
 
 
183 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  47.98 
 
 
182 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  47.67 
 
 
177 aa  167  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  48.26 
 
 
189 aa  167  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  48.84 
 
 
182 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  47.34 
 
 
174 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  47.73 
 
 
209 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  48.31 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  47.95 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  46.59 
 
 
212 aa  165  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  47.98 
 
 
187 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  50 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  44.51 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  45.36 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  49.71 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  47.56 
 
 
182 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  44.19 
 
 
182 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  49.1 
 
 
187 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  48.54 
 
 
188 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.17 
 
 
196 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  45.56 
 
 
180 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  42.11 
 
 
182 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  45.88 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  47.4 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  46.15 
 
 
201 aa  150  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  45.66 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  44.77 
 
 
199 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  45.6 
 
 
201 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  47.13 
 
 
200 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  44.02 
 
 
182 aa  148  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  41.38 
 
 
184 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  43.93 
 
 
195 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  42.53 
 
 
182 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  42.53 
 
 
182 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  42.53 
 
 
182 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  41.52 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  40.49 
 
 
195 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  44.25 
 
 
201 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  44.77 
 
 
201 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  45.03 
 
 
223 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  41.34 
 
 
181 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  41.48 
 
 
177 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  43.1 
 
 
181 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  39.53 
 
 
175 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  45.03 
 
 
201 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  37.21 
 
 
285 aa  141  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  44.77 
 
 
201 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  44.44 
 
 
201 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  44.51 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  42.29 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  38.32 
 
 
229 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  44.51 
 
 
175 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  44.85 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  41.72 
 
 
178 aa  137  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  40.7 
 
 
186 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  42.46 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  40 
 
 
175 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  37 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  41.9 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  43.48 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  36.63 
 
 
177 aa  130  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.6 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  41.28 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  39.46 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  36.57 
 
 
192 aa  123  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  35.84 
 
 
202 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  38.79 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  42.66 
 
 
179 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  35.67 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  36.78 
 
 
196 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  36.84 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  38.95 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  40 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  36.93 
 
 
199 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  35.15 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>