232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2875 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
248 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  53.23 
 
 
261 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.99 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  51.24 
 
 
263 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  38.93 
 
 
267 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  45.12 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  39.84 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  39.27 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  39.27 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  41.06 
 
 
247 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  40.41 
 
 
249 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  36.29 
 
 
254 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  39.75 
 
 
247 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  41.39 
 
 
251 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  37.5 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  38.52 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  38.52 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  37.3 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  38.52 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  35.89 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  36.07 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  39.02 
 
 
255 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
251 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  36.84 
 
 
251 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  36.89 
 
 
251 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.84 
 
 
244 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  39.36 
 
 
264 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  38.11 
 
 
250 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.56 
 
 
252 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  38.55 
 
 
251 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  38.11 
 
 
250 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
251 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
402 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  35.92 
 
 
251 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  38.52 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  35.63 
 
 
251 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  36.07 
 
 
250 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
254 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  34.55 
 
 
273 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  39.58 
 
 
243 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  35.74 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  34.94 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  34.02 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  33.61 
 
 
250 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  39.18 
 
 
254 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  39.18 
 
 
252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  39.18 
 
 
252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  35.25 
 
 
251 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  36.48 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  35.66 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  39.37 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  33.61 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  36.03 
 
 
252 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  39.04 
 
 
244 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.77 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  35.25 
 
 
244 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  35.27 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  40.68 
 
 
312 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  35.77 
 
 
246 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.56 
 
 
258 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.91 
 
 
251 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  33.94 
 
 
279 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.32 
 
 
249 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
264 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  41.35 
 
 
137 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  33.97 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  32.3 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.92 
 
 
252 aa  92  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.68 
 
 
253 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  34.72 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  34.23 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  37.04 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.21 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.18 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.02 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.45 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.54 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.5 
 
 
291 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.67 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>