More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2869 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  61.64 
 
 		 221 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.01 
 
 		 220 aa  258  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.33 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  56.16 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  57.21 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.01 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  52.75 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  60.65 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.72 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.68 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  38.25 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  38.25 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 244 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  39.01 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  40.36 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  42.59 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.15 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  38.53 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  36.77 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.99 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0004  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000117037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.36 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  43.27 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  39.37 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.1 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  41.28 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  41.28 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  41.28 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  41.28 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>