More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2729 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 134 aa  259  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  53.17 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  54.47 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  52.44 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  61.25 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  56 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  42.28 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  51.35 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  53.33 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  49.43 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  48.06 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  55.41 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  49.38 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  49.33 
 
 		 321 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  44.87 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  34.55 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  50.65 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  52.7 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  53.62 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 321 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  40.16 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  43.42 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  55.38 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  30.83 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  48.68 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.19 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  51.47 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  41.56 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 464 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.16 
 
 		 593 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>