More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2652 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  67.58 
 
 
260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  66.54 
 
 
255 aa  333  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.5 
 
 
254 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  58.73 
 
 
250 aa  278  9e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  66.18 
 
 
200 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.41 
 
 
320 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
277 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.08 
 
 
265 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  45.82 
 
 
250 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  41.63 
 
 
244 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  41.63 
 
 
244 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 
251 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  40.71 
 
 
297 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 
251 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 
237 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  40.56 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  40.56 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 
231 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
248 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
230 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 
251 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  40.39 
 
 
251 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40 
 
 
231 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 
232 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.13 
 
 
232 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.37 
 
 
243 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  38.31 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  40.24 
 
 
233 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 
235 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  40.32 
 
 
231 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  40.39 
 
 
240 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
246 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
246 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 
230 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 
227 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.54 
 
 
236 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.03 
 
 
219 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 
228 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 
321 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  35.63 
 
 
230 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.69 
 
 
229 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  38.25 
 
 
229 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.04 
 
 
239 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.11 
 
 
222 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 
231 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  35.69 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  38.31 
 
 
229 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 
224 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 
229 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 
229 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.46 
 
 
239 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  36.9 
 
 
232 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 
222 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  38.8 
 
 
232 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  32.53 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
237 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
237 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
237 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 
231 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.18 
 
 
235 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  34.41 
 
 
238 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 
228 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 
244 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 
229 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  31.05 
 
 
240 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  31.05 
 
 
240 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 
237 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 
237 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 
231 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 
240 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  38 
 
 
245 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  33.2 
 
 
234 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  34 
 
 
243 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 
232 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 
235 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  36 
 
 
236 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.54 
 
 
235 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  35.63 
 
 
226 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 
237 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  35.27 
 
 
240 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 
234 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 
235 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 
233 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 
234 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  33.6 
 
 
243 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 
226 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>