209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2649 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  100 
 
 
310 aa  614  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  75.09 
 
 
310 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  48.87 
 
 
316 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  46.93 
 
 
309 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  43.14 
 
 
316 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  44.79 
 
 
310 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  38.41 
 
 
660 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  34.75 
 
 
332 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  32.29 
 
 
327 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  34.31 
 
 
327 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  32.94 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  37.7 
 
 
329 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  38.83 
 
 
326 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  34.39 
 
 
321 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  34.55 
 
 
325 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  31.66 
 
 
283 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  32.37 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  33.33 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.14 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  34.55 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  34.29 
 
 
322 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  36.07 
 
 
325 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  36.09 
 
 
275 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  34.27 
 
 
325 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  33.99 
 
 
310 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.5 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  34.98 
 
 
282 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  37.21 
 
 
322 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  35.85 
 
 
321 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  34.01 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  33.65 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  35.56 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  33.33 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  33.17 
 
 
332 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  35 
 
 
330 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  33.52 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  27.52 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  32.98 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.02 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.47 
 
 
316 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  31.76 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  32.85 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  35.56 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.71 
 
 
320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  35.56 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  35.56 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  30.29 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  34.48 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  32.78 
 
 
323 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  34.67 
 
 
324 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.79 
 
 
320 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.5 
 
 
337 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  36.6 
 
 
313 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  30.58 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  30.04 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.54 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.97 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  35.56 
 
 
325 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.82 
 
 
314 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.08 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.93 
 
 
290 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  29.1 
 
 
321 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  27.84 
 
 
328 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.85 
 
 
324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.57 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  33.17 
 
 
320 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.57 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.35 
 
 
335 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  31.16 
 
 
322 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.62 
 
 
320 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  30.58 
 
 
284 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  28.57 
 
 
325 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  28.22 
 
 
335 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  30.87 
 
 
325 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  25.71 
 
 
325 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.22 
 
 
327 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.43 
 
 
325 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.39 
 
 
324 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.46 
 
 
325 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  33.52 
 
 
331 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  33.52 
 
 
331 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  33.52 
 
 
331 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  33.52 
 
 
331 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  33.52 
 
 
331 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  33.52 
 
 
331 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.22 
 
 
326 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  33.15 
 
 
306 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  27.73 
 
 
324 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  33.33 
 
 
330 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  29.28 
 
 
328 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.04 
 
 
322 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.62 
 
 
337 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.46 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  30.64 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  30.77 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.98 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  30.43 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  30.43 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.84 
 
 
324 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.56 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>