More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2532 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
379 aa  754    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.21 
 
 
382 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  59.62 
 
 
383 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.27 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  62.13 
 
 
378 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  57.49 
 
 
365 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  58.27 
 
 
363 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  55.23 
 
 
363 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.99 
 
 
370 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  59.2 
 
 
368 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  56.5 
 
 
396 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  57.98 
 
 
382 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  57.57 
 
 
359 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  58.52 
 
 
379 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  56.76 
 
 
359 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.99 
 
 
363 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.13 
 
 
379 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  53.53 
 
 
376 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  51.68 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.2 
 
 
382 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  55.15 
 
 
353 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.26 
 
 
433 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.53 
 
 
368 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.15 
 
 
359 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  51.67 
 
 
368 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.27 
 
 
362 aa  329  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 
618 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  54.08 
 
 
361 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.93 
 
 
330 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.93 
 
 
330 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.63 
 
 
330 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  53.76 
 
 
373 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.97 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.31 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.17 
 
 
285 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.89 
 
 
411 aa  259  7e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  38.31 
 
 
388 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  37.18 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 
396 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.62 
 
 
383 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36 
 
 
405 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  38.84 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.21 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.01 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.3 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.05 
 
 
396 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 
397 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.6 
 
 
385 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 
417 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 
399 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 
396 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.05 
 
 
399 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  32.23 
 
 
397 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  34.15 
 
 
399 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.41 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  32.23 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  30.79 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.41 
 
 
388 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  32.74 
 
 
398 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  34.26 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.15 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 
382 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  31.5 
 
 
382 aa  162  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  31.99 
 
 
410 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  32.57 
 
 
397 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 
405 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 
386 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 
405 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  32.21 
 
 
402 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  30.98 
 
 
407 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.17 
 
 
388 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 
391 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.02 
 
 
385 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  33 
 
 
398 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  31.82 
 
 
405 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  31.54 
 
 
410 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  32.05 
 
 
398 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  32.65 
 
 
398 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  31.09 
 
 
403 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 
410 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.31 
 
 
389 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  32.98 
 
 
387 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  32.16 
 
 
410 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  32.16 
 
 
410 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  32.61 
 
 
420 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  32.16 
 
 
410 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  31.2 
 
 
399 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.11 
 
 
390 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.99 
 
 
388 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  32.39 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  32.39 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  31.25 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 
409 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.31 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  32.15 
 
 
399 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 
392 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 
394 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>