More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2484 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  74.79 
 
 
249 aa  367  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  73.95 
 
 
247 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  73.53 
 
 
247 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  73.53 
 
 
247 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  72.69 
 
 
243 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  70.59 
 
 
243 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.57 
 
 
510 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.49 
 
 
516 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
502 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  59.09 
 
 
507 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  62.4 
 
 
260 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.85 
 
 
241 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60.43 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.15 
 
 
241 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.15 
 
 
241 aa  278  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.15 
 
 
241 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.57 
 
 
241 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.72 
 
 
241 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.66 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.47 
 
 
240 aa  272  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  55.97 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.16 
 
 
240 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.87 
 
 
244 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.72 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.63 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.72 
 
 
242 aa  267  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.2 
 
 
242 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 
273 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  58.55 
 
 
246 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.3 
 
 
242 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.3 
 
 
242 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.87 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  56.78 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.32 
 
 
240 aa  265  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
244 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.69 
 
 
246 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  56.6 
 
 
256 aa  263  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  57.69 
 
 
246 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.36 
 
 
244 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.72 
 
 
239 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.97 
 
 
249 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.9 
 
 
255 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.38 
 
 
249 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
244 aa  262  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  56.03 
 
 
250 aa  262  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.66 
 
 
242 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.51 
 
 
240 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
242 aa  261  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.81 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.67 
 
 
246 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.89 
 
 
242 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.04 
 
 
242 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.2 
 
 
246 aa  259  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.04 
 
 
247 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.32 
 
 
253 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.47 
 
 
242 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
240 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.74 
 
 
252 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 
244 aa  258  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  56.96 
 
 
248 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.32 
 
 
243 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.83 
 
 
262 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.32 
 
 
243 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  55.32 
 
 
253 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.57 
 
 
243 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
247 aa  256  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.54 
 
 
244 aa  256  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  55.6 
 
 
253 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.04 
 
 
242 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.51 
 
 
247 aa  255  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
252 aa  254  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 
258 aa  254  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
257 aa  254  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.6 
 
 
240 aa  254  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.24 
 
 
240 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.89 
 
 
243 aa  254  9e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.04 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  59.4 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55.36 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  54.39 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  57.26 
 
 
254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.42 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.51 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  57.26 
 
 
254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.89 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  51.88 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  53.65 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  57.26 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  54.24 
 
 
247 aa  252  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 
251 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
273 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>