More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2398 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  100 
 
 
474 aa  959    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  80.22 
 
 
464 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  32.63 
 
 
477 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.75 
 
 
462 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  34.47 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.71 
 
 
446 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  25.92 
 
 
441 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  27.77 
 
 
431 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  27.66 
 
 
419 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  35.07 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.28 
 
 
376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.54 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  26.82 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  25.17 
 
 
399 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  50 
 
 
253 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.87 
 
 
751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  27.33 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  24.48 
 
 
399 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.56 
 
 
379 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  45.83 
 
 
254 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  48.59 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  28.47 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  51.56 
 
 
276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.42 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  43.56 
 
 
727 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.13 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.72 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  43.56 
 
 
727 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.85 
 
 
402 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.81 
 
 
824 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.99 
 
 
453 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  33.08 
 
 
377 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.26 
 
 
457 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.53 
 
 
456 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.53 
 
 
459 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  49.23 
 
 
137 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.07 
 
 
446 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.31 
 
 
375 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  40.1 
 
 
402 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  31.34 
 
 
375 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.96 
 
 
442 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.25 
 
 
391 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.85 
 
 
301 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  47.29 
 
 
414 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.14 
 
 
392 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.14 
 
 
392 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.53 
 
 
454 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  43.41 
 
 
308 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.96 
 
 
676 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  48.8 
 
 
487 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.43 
 
 
447 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  43.26 
 
 
697 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.43 
 
 
447 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  43.36 
 
 
318 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.46 
 
 
288 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.71 
 
 
287 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  43.26 
 
 
697 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.75 
 
 
452 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  42.25 
 
 
681 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  44.37 
 
 
754 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.41 
 
 
590 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.55 
 
 
699 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  50.79 
 
 
216 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  41.73 
 
 
443 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.12 
 
 
321 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.13 
 
 
695 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  34.47 
 
 
312 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  45.19 
 
 
332 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.26 
 
 
303 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  44.8 
 
 
340 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  44.53 
 
 
290 aa  97.8  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.09 
 
 
430 aa  97.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.93 
 
 
524 aa  97.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  38.14 
 
 
285 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  40.44 
 
 
300 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.53 
 
 
482 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  43.66 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  41.98 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  40 
 
 
550 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  42.19 
 
 
274 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  49.61 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.74 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  39.26 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  42.64 
 
 
665 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  44.19 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  44.19 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  44.19 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  39.39 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.44 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.8 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  27.53 
 
 
424 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.09 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  44.44 
 
 
328 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  44.8 
 
 
300 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  42.07 
 
 
529 aa  94.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.42 
 
 
400 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  40.14 
 
 
450 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.79 
 
 
372 aa  94  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  40.29 
 
 
683 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  46.73 
 
 
333 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>