233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2360 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2360  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000706086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  66.44 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  51.06 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  45.71 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1526  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  33.33 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0153  thiamine biosynthesis lipoprotein, ApbE family  31.27 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.191913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  26.55 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  29.58 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.82 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  25.97 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.43 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.5 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  26.55 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  31.19 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.91 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  32.35 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  34.5 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.92 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  26.71 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.14 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  31.32 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  35.06 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  22 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  24.56 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  26.72 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  29.08 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.44 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  21.53 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.59 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  24.46 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.43 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  32.56 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  32.43 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.12 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.18 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  33.54 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  24.1 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  22.44 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  29.94 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  26.82 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  26.76 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  27.97 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  28.67 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  25 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.03 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  30.58 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  24.84 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  27.59 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  23.05 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  28.67 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.87 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  25.99 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.55 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.45 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  25.99 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.99 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  33.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  28.06 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  33.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  33.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  33.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.45 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1418  apbE family protein  26.25 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  34.81 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  34.81 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  31.3 
 
 		 800 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.24 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.64 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  24.19 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  27.48 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  24.92 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  33.85 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  29.13 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.91 
 
 		 361 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  26.59 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  26.52 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  34.18 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>