125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2334 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  66 
 
 
877 aa  1033    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
844 aa  1666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  37.87 
 
 
905 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  38.98 
 
 
850 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  33.09 
 
 
839 aa  361  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  32.22 
 
 
857 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  28.44 
 
 
852 aa  294  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  42.94 
 
 
723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  43.79 
 
 
346 aa  254  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
1118 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  28.05 
 
 
556 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  26.67 
 
 
568 aa  120  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  29.43 
 
 
556 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  29.43 
 
 
556 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
1132 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.98 
 
 
861 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.01 
 
 
861 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.01 
 
 
859 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.01 
 
 
861 aa  103  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.01 
 
 
861 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.01 
 
 
861 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.54 
 
 
859 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.01 
 
 
861 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  23 
 
 
851 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.01 
 
 
861 aa  102  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  24.01 
 
 
861 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.01 
 
 
861 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  24.05 
 
 
858 aa  100  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  22.68 
 
 
851 aa  99.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  27.1 
 
 
847 aa  95.5  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  27.61 
 
 
896 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  26.23 
 
 
597 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
1113 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  26.71 
 
 
880 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  28.77 
 
 
854 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25 
 
 
851 aa  92.8  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  26.38 
 
 
599 aa  92.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.36 
 
 
880 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  26.4 
 
 
880 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  24.85 
 
 
592 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.88 
 
 
850 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  24.6 
 
 
870 aa  88.6  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  26.4 
 
 
880 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25 
 
 
863 aa  87  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.17 
 
 
844 aa  86.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  23.93 
 
 
863 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  26.39 
 
 
578 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.62 
 
 
854 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  24.76 
 
 
879 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.37 
 
 
872 aa  84  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  23.21 
 
 
862 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.08 
 
 
880 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.09 
 
 
883 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  26.3 
 
 
866 aa  80.9  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  22.33 
 
 
917 aa  79.7  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  23.93 
 
 
871 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  23.93 
 
 
871 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  22.7 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.01 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  26.13 
 
 
881 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  24.06 
 
 
869 aa  77.4  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  24.05 
 
 
880 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.62 
 
 
864 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  22.37 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  25.17 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  29.03 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  25.16 
 
 
881 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  24.05 
 
 
864 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  22.4 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  22.4 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  23.73 
 
 
850 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  25 
 
 
855 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  23.19 
 
 
864 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  23.01 
 
 
701 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  23.71 
 
 
864 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  24.92 
 
 
876 aa  72.4  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
1100 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 
1094 aa  71.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  23.62 
 
 
889 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  23.62 
 
 
889 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  23.62 
 
 
889 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  26.11 
 
 
867 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  26.8 
 
 
877 aa  70.1  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  23 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.6 
 
 
867 aa  68.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 
1120 aa  67.8  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  22.68 
 
 
864 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  23.05 
 
 
880 aa  66.6  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  23.05 
 
 
880 aa  66.6  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  22.68 
 
 
864 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
1101 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  21.81 
 
 
813 aa  65.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  23.22 
 
 
872 aa  65.1  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  25.08 
 
 
864 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  24.54 
 
 
844 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 
1100 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  24.54 
 
 
844 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 
1138 aa  62.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.77 
 
 
1147 aa  62.4  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  22.67 
 
 
1098 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>