More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2303 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  58.85 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  53.42 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  48.43 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  36.94 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  31.02 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  31.64 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  32.3 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  31.64 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  37.62 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  29.51 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  37.82 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  35.94 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  29.68 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  31.58 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  33.69 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  28.71 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.53 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.76 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  28.84 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.38 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.64 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  28.77 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  33.09 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  25.94 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  33.16 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  28.77 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  33.51 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  32.85 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.9 
 
 		 569 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  30.35 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  33.51 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>