More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2210 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  100 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  74.4 
 
 
308 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.76 
 
 
300 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.76 
 
 
300 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.76 
 
 
300 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.45 
 
 
300 aa  319  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  56.16 
 
 
312 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.76 
 
 
319 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  58.9 
 
 
298 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  50.97 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.95 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  53.9 
 
 
292 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  57.63 
 
 
304 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  52.54 
 
 
310 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  53.25 
 
 
346 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.85 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  52.74 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  54.11 
 
 
308 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  52.19 
 
 
325 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  56.27 
 
 
289 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  52.22 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  50.33 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  46.18 
 
 
336 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  54.58 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.23 
 
 
322 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.24 
 
 
355 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  48.47 
 
 
336 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  48.38 
 
 
380 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  48.16 
 
 
344 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  45.31 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  39.38 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  40.86 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  53.72 
 
 
329 aa  228  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  44 
 
 
313 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  43.29 
 
 
294 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.31 
 
 
307 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  45.19 
 
 
363 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 
307 aa  221  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  38.31 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  44.85 
 
 
332 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 
293 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  40.2 
 
 
301 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  43.59 
 
 
317 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 
301 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.72 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.97 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  45.98 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.67 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.72 
 
 
299 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  38.72 
 
 
295 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  40.47 
 
 
305 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
296 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
296 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.66 
 
 
295 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  42.91 
 
 
294 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
296 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
296 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
296 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
296 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  39.66 
 
 
290 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 
296 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  47.28 
 
 
385 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.39 
 
 
296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.18 
 
 
296 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.39 
 
 
296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 
296 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  44.18 
 
 
306 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  40.94 
 
 
302 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 
300 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  42.11 
 
 
304 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  41.53 
 
 
317 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  45.57 
 
 
327 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  40.4 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  39.62 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 
296 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.07 
 
 
300 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.08 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  35.47 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 
294 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 
295 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 
295 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  39.07 
 
 
308 aa  199  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  41.14 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.71 
 
 
342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35.49 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  41.61 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  40.56 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.82 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>