More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2145 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  97.06 
 
 		 102 aa  197  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  73.27 
 
 		 102 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  74.51 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  70.3 
 
 		 101 aa  140  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 106 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  67 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 101 aa  133  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  133  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  62 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  63 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  56 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  56 
 
 		 103 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  55.77 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  59 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  54.55 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  38 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  39 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  37.62 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  39.6 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  36.63 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  39 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>