102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2056 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  74.15 
 
 		 167 aa  226  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  55.7 
 
 		 335 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  51.95 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  47.43 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  51.92 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  47.56 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 305 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  43.37 
 
 		 484 aa  120  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  44.16 
 
 		 475 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  45.27 
 
 		 287 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 		 291 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  48.52 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  41.29 
 
 		 299 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 292 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.62 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.06 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 199 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 191 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.3 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.3 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 234 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.3 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.45 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.01 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  29.31 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  36.44 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.71 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  33.61 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  28.1 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  33.63 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.08 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  34.72 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 243 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 304 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  25.22 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  37.62 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  51.22 
 
 		 149 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  33.75 
 
 		 315 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  38.78 
 
 		 126 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 242 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  32.99 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.23 
 
 		 211 aa  41.2  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 228 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 228 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 228 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.36 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  32 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.18 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.36 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>