More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2015 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 880 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 888 aa  886    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 898 aa  1825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 885 aa  892    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 897 aa  1008    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 892 aa  912    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 		 893 aa  983    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 898 aa  904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 897 aa  885    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 892 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 893 aa  894    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 896 aa  858    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 904 aa  861    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 889 aa  900    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  68.68 
 
 		 903 aa  1201    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 889 aa  877    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 879 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 889 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 895 aa  962    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 890 aa  957    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 876 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  52.57 
 
 		 894 aa  859    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 891 aa  949    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 881 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 889 aa  897    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 897 aa  864    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 890 aa  936    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 874 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 895 aa  961    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 897 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 879 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 892 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 892 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 895 aa  909    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 876 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 878 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  52.97 
 
 		 890 aa  842    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  90.02 
 
 		 892 aa  1633    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 886 aa  848    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 896 aa  863    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 893 aa  966    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 897 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 888 aa  888    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 898 aa  883    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 900 aa  900    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 902 aa  914    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 886 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 889 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 886 aa  635  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 876 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  632  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  632  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 876 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 860 aa  631  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  632  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  41.42 
 
 		 876 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 886 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 860 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 865 aa  632  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 876 aa  632  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 865 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 874 aa  629  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 876 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 874 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 869 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 883 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 860 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 878 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 874 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 877 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 877 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 886 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 876 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 876 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 889 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 863 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 868 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 897 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 892 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 874 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>