25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1894 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  100 
 
 
372 aa  751    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  62.5 
 
 
373 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  32.8 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  31.35 
 
 
384 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3804  hypothetical protein  26.4 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  29.21 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  30.18 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  29.95 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.72 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  27.88 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  29.61 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  24.42 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  23.04 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  25.35 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  24.64 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  27.97 
 
 
708 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  26.35 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  31.18 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  20.54 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  20.54 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  25.83 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  27.38 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  27.5 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>