162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1879 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
365 aa  742    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  86 
 
 
372 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  65.04 
 
 
352 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  61.93 
 
 
364 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  62.75 
 
 
349 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.58 
 
 
354 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  59.31 
 
 
349 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.71 
 
 
349 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.31 
 
 
349 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  58.38 
 
 
358 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  58.1 
 
 
358 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  58.2 
 
 
257 aa  315  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  59.39 
 
 
261 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  55.56 
 
 
261 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.46 
 
 
259 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  53.69 
 
 
253 aa  225  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  35.15 
 
 
245 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.08 
 
 
530 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.09 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.3 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.59 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.45 
 
 
329 aa  99.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  57.14 
 
 
91 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  31.09 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  30.21 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  30.13 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  30.21 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.67 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  29.18 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.72 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.67 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.63 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.9 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  31.34 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  28.33 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  57.61 
 
 
92 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  58.89 
 
 
94 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.25 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  28.17 
 
 
329 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  31.69 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  53.19 
 
 
94 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.06 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  31.88 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  27.7 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  31.2 
 
 
325 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.54 
 
 
278 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  28.71 
 
 
334 aa  87.4  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.27 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.27 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.06 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  28.79 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.79 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  28.1 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.99 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  27 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.19 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.96 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  24.38 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.82 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.44 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.44 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.51 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.49 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.16 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.14 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.87 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.74 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  24.15 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.38 
 
 
240 aa  77  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  31.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.73 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.24 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.3 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.9 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.3 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  28 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.28 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.44 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  29.28 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>