More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1808 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  68.03 
 
 
315 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  67.24 
 
 
316 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  37.19 
 
 
298 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  39.58 
 
 
300 aa  215  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  37.63 
 
 
305 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.09 
 
 
298 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  35.79 
 
 
298 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
308 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  40.82 
 
 
315 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.74 
 
 
321 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
309 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  36.46 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
299 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 
303 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 
303 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
294 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
294 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  36.43 
 
 
294 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
294 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  34.49 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  37.63 
 
 
292 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.57 
 
 
291 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
305 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  35.74 
 
 
303 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35.46 
 
 
294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  35.92 
 
 
292 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.89 
 
 
299 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.89 
 
 
299 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.66 
 
 
297 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  39.11 
 
 
303 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
266 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  37.46 
 
 
317 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 
299 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  35.05 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  40 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  42.53 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  39.09 
 
 
406 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
307 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37.85 
 
 
326 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  36.61 
 
 
341 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  35.49 
 
 
304 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  33.67 
 
 
296 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.73 
 
 
309 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
296 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
294 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.9 
 
 
309 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
305 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
303 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
319 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.34 
 
 
326 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  38.64 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  34.98 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  38.18 
 
 
297 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.63 
 
 
312 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.45 
 
 
298 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  42.44 
 
 
304 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  38.16 
 
 
293 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.67 
 
 
293 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  40.67 
 
 
304 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.28 
 
 
309 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.29 
 
 
326 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 
310 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
311 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  32.99 
 
 
295 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  32.56 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  41.12 
 
 
340 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.78 
 
 
320 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 
373 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  36.36 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  33.88 
 
 
339 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  36.73 
 
 
303 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.95 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.64 
 
 
319 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  32.31 
 
 
312 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  38.5 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.95 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.5 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.32 
 
 
317 aa  149  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.57 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  38.01 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  39.71 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  31.74 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.23 
 
 
320 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
318 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 
344 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  38.1 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  27.87 
 
 
297 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.98 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>