More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1784 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1784  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 
871 aa  1654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000613438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18990  ATP-dependent helicase HrpB  54.4 
 
 
839 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.127417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03650  ATP-dependent helicase HrpB  56.07 
 
 
861 aa  728    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2026  ATP-dependent helicase HrpB  70.86 
 
 
897 aa  1070    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.79914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04570  ATP-dependent helicase HrpB  54.59 
 
 
893 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0937803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  49.59 
 
 
830 aa  602  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7166  ATP-dependent helicase HrpB  49.17 
 
 
885 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  46.18 
 
 
841 aa  568  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  49.88 
 
 
855 aa  562  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6512  ATP-dependent helicase HrpB  48.19 
 
 
862 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  49.07 
 
 
843 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  50.41 
 
 
856 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  48.6 
 
 
836 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  47.03 
 
 
880 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  39.42 
 
 
827 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  45.15 
 
 
772 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  39.3 
 
 
828 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  41.47 
 
 
837 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  41.01 
 
 
832 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  38.26 
 
 
842 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  38.86 
 
 
844 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  39.88 
 
 
842 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  42.03 
 
 
838 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  41.15 
 
 
846 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  39.76 
 
 
825 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  37.98 
 
 
820 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  42.71 
 
 
848 aa  446  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  38.43 
 
 
844 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  38.76 
 
 
821 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  39.77 
 
 
842 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  36.45 
 
 
864 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  39.86 
 
 
842 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  42.05 
 
 
838 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  38.2 
 
 
870 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  39.58 
 
 
825 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  39.72 
 
 
830 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  37.81 
 
 
818 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  38.62 
 
 
821 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  35.03 
 
 
856 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  38.39 
 
 
832 aa  432  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  41.05 
 
 
826 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  38.67 
 
 
824 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  35.05 
 
 
849 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  38.82 
 
 
839 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  40.72 
 
 
829 aa  429  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  34.42 
 
 
854 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  37.35 
 
 
825 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  36.75 
 
 
840 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  37.5 
 
 
798 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  39.61 
 
 
826 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  38.72 
 
 
822 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  41.65 
 
 
860 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  34.78 
 
 
826 aa  426  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  40.83 
 
 
830 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  38.4 
 
 
824 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  34.73 
 
 
835 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  39.45 
 
 
842 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  39.26 
 
 
833 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  34.62 
 
 
856 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  40.75 
 
 
844 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  38.28 
 
 
844 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  34.73 
 
 
835 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  39.11 
 
 
842 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  35.41 
 
 
835 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  39.55 
 
 
854 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  34.77 
 
 
835 aa  416  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  37.43 
 
 
872 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  37.44 
 
 
829 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  37.6 
 
 
821 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.1 
 
 
833 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  40.66 
 
 
814 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.82 
 
 
812 aa  409  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  39.1 
 
 
825 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  40.42 
 
 
850 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  32.71 
 
 
822 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  36.51 
 
 
877 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  33.56 
 
 
846 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  37.44 
 
 
900 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  40.95 
 
 
917 aa  399  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.25 
 
 
820 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.85 
 
 
834 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.85 
 
 
829 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  36.81 
 
 
834 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.8 
 
 
853 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.53 
 
 
814 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  40.23 
 
 
834 aa  389  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  39.05 
 
 
847 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.49 
 
 
824 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.49 
 
 
824 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  37.8 
 
 
841 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  40.72 
 
 
837 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  34.62 
 
 
848 aa  386  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.49 
 
 
824 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  35.27 
 
 
833 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  34.3 
 
 
824 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.54 
 
 
809 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  32.87 
 
 
855 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  36.64 
 
 
821 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.43 
 
 
809 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  32.87 
 
 
842 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>