More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1764 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
223 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  55.98 
 
 
211 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  55.17 
 
 
203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  51.21 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  43.14 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  43.54 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  41.58 
 
 
200 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  44.67 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.09 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.93 
 
 
217 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.75 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 
221 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  32.76 
 
 
202 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  34.23 
 
 
224 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 
209 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.16 
 
 
237 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 
216 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  32.47 
 
 
218 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  35.03 
 
 
237 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.86 
 
 
220 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  31.35 
 
 
245 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  31.05 
 
 
206 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.67 
 
 
256 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.68 
 
 
268 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  32.51 
 
 
259 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.37 
 
 
521 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  33.5 
 
 
212 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  32.68 
 
 
204 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  40.78 
 
 
207 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 
363 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  39.86 
 
 
198 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  29.06 
 
 
229 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.43 
 
 
211 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  35.47 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.9 
 
 
221 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  37.14 
 
 
471 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  33.49 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  36 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.23 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32.27 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.99 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  30.46 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  30.93 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.99 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.99 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.14 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  29.95 
 
 
682 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  30.45 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  29.95 
 
 
682 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  30.28 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.98 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  30.98 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.09 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  29.15 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.17 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  34.31 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34 
 
 
702 aa  95.5  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  34.69 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  30.66 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.79 
 
 
216 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  29.8 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  40.1 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  29.15 
 
 
230 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  32.38 
 
 
223 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  30.24 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.65 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  36.61 
 
 
473 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.61 
 
 
219 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.61 
 
 
219 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.61 
 
 
219 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.61 
 
 
219 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  34.64 
 
 
213 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  92  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.61 
 
 
219 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.84 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  29.3 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  33.71 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.64 
 
 
664 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.77 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  29.35 
 
 
678 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  29.3 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.77 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  37.33 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.77 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.77 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>