35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1677 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  440  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  92.06 
 
 
214 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  42.51 
 
 
210 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  43.06 
 
 
206 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  41.59 
 
 
211 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  40.89 
 
 
238 aa  141  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  40.19 
 
 
205 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  40.19 
 
 
205 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  41.67 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  39.72 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  39.15 
 
 
248 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.71 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  37.74 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  35.98 
 
 
207 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  42.46 
 
 
221 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  37.85 
 
 
207 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  42.01 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  33.49 
 
 
209 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  36.62 
 
 
209 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  36.97 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  34.86 
 
 
210 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  36.71 
 
 
210 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  35.32 
 
 
240 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.89 
 
 
214 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  37.85 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  35.18 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  32.11 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  33.18 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  30.65 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  31.68 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  28.8 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>