More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1598 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  100 
 
 
339 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  92.92 
 
 
335 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  93.18 
 
 
335 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  99.41 
 
 
347 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  71.43 
 
 
333 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  71.43 
 
 
333 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  70.75 
 
 
332 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  70.87 
 
 
342 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  71.52 
 
 
337 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  70.54 
 
 
333 aa  504  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  70.12 
 
 
334 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  73.98 
 
 
317 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  70.52 
 
 
341 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  73.46 
 
 
312 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  68.15 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  73.31 
 
 
316 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.44 
 
 
335 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  74.58 
 
 
320 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  72.84 
 
 
329 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  73.23 
 
 
325 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  72.55 
 
 
317 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  73.23 
 
 
325 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  73.23 
 
 
325 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  73.93 
 
 
331 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  72.52 
 
 
311 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  66.77 
 
 
339 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  71.9 
 
 
309 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  74.25 
 
 
323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  68.57 
 
 
333 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  71.43 
 
 
305 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  71.19 
 
 
306 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  70.63 
 
 
332 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  69.71 
 
 
311 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  70.96 
 
 
308 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  63.02 
 
 
340 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  70.49 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  65.03 
 
 
328 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  67.43 
 
 
333 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  68.09 
 
 
323 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  63.61 
 
 
308 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  48.18 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.19 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.72 
 
 
321 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.21 
 
 
304 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  45.67 
 
 
325 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  47.58 
 
 
291 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.74 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  46.52 
 
 
298 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  46.25 
 
 
328 aa  272  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  45.79 
 
 
304 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  46.15 
 
 
308 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.72 
 
 
299 aa  268  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  48.35 
 
 
276 aa  268  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  46.26 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  47.45 
 
 
535 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  43.06 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  45.7 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  45.7 
 
 
315 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.62 
 
 
288 aa  265  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.21 
 
 
355 aa  265  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  45.65 
 
 
314 aa  265  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  45.16 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  45.16 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.99 
 
 
290 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  46.15 
 
 
299 aa  263  4e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  45.62 
 
 
297 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  44.8 
 
 
298 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.48 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.72 
 
 
309 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  42.66 
 
 
302 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  45.26 
 
 
291 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  46.83 
 
 
304 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  44.44 
 
 
304 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  42.03 
 
 
347 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  43.94 
 
 
351 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  46.69 
 
 
324 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  43.89 
 
 
320 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.39 
 
 
334 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  42.03 
 
 
347 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  45.73 
 
 
311 aa  259  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  43.41 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  44.77 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  42.18 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  43.41 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  42.91 
 
 
323 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  43.82 
 
 
321 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  45.32 
 
 
321 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  43.88 
 
 
305 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  43.88 
 
 
305 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  42.57 
 
 
327 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>