54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1371 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  100 
 
 
484 aa  968    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  81.92 
 
 
499 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  44.72 
 
 
422 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  44.27 
 
 
484 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  43.18 
 
 
406 aa  286  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  40.58 
 
 
428 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  36.1 
 
 
436 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  40.42 
 
 
411 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  41.49 
 
 
427 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  37.45 
 
 
563 aa  243  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  44.09 
 
 
438 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  51.11 
 
 
416 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  40.52 
 
 
413 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  41.97 
 
 
386 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  36 
 
 
397 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  38.26 
 
 
449 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  39.31 
 
 
513 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  39.09 
 
 
424 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  39.09 
 
 
424 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  42.01 
 
 
447 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  37.27 
 
 
448 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  39.9 
 
 
410 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  39.54 
 
 
404 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  43.14 
 
 
480 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  40.46 
 
 
599 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  31.95 
 
 
404 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  30.06 
 
 
393 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  35.29 
 
 
345 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  35.06 
 
 
446 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  32.37 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  31.74 
 
 
451 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  28.83 
 
 
392 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.84 
 
 
385 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.17 
 
 
382 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  27.87 
 
 
370 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  25.48 
 
 
404 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  29.88 
 
 
386 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  28.63 
 
 
373 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.87 
 
 
409 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  30.6 
 
 
395 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  96.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  25.87 
 
 
434 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  31.11 
 
 
376 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  26.4 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  21.53 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  25.87 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  23.69 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  23.88 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  23.88 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.19 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.19 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  31.75 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  26.67 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  23.32 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>