49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1358 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  86.54 
 
 
255 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  57.83 
 
 
282 aa  278  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  53.12 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  51.19 
 
 
256 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  51.59 
 
 
256 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  51.37 
 
 
263 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  49.65 
 
 
295 aa  234  9e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  51.11 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  50.58 
 
 
253 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  50.2 
 
 
242 aa  211  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  49.19 
 
 
273 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  45.88 
 
 
269 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  43.31 
 
 
258 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  45.56 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  41.6 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  46.99 
 
 
437 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  42.8 
 
 
264 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  41.22 
 
 
277 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  38.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  41.3 
 
 
286 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  38.71 
 
 
257 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  38.98 
 
 
255 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  41.91 
 
 
241 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  38.31 
 
 
264 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  38.19 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  42.91 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  40.08 
 
 
268 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  38.93 
 
 
259 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  38.58 
 
 
268 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  38.58 
 
 
268 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  38.21 
 
 
302 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  39.15 
 
 
259 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  39.15 
 
 
259 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  29.87 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  28.35 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  31.73 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  30.23 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  29.11 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.75 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  30.34 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.76 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.76 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.76 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.76 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.35 
 
 
313 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  28.57 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  24.48 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.31 
 
 
337 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>