80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1200 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  90.94 
 
 
256 aa  477  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  64.66 
 
 
259 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  64.66 
 
 
250 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  63.86 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  46.43 
 
 
408 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  47.83 
 
 
412 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  49.2 
 
 
405 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  47.6 
 
 
410 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  44.18 
 
 
413 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  46.25 
 
 
406 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  45.63 
 
 
406 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  46 
 
 
423 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  43.78 
 
 
402 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  46.53 
 
 
397 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  46.4 
 
 
407 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  46.18 
 
 
409 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  44.58 
 
 
405 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  42.11 
 
 
251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  39.6 
 
 
405 aa  212  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  45.38 
 
 
406 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  47.41 
 
 
407 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  46.8 
 
 
406 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  43.2 
 
 
415 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  43.25 
 
 
409 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  44.63 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  44.07 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  50.4 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  42.52 
 
 
410 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  42.97 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  40.94 
 
 
410 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  46.03 
 
 
408 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  40.64 
 
 
258 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  45.82 
 
 
408 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  44.66 
 
 
259 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
256 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  32.8 
 
 
259 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  45.14 
 
 
145 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  34.52 
 
 
411 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.98 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.11 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.68 
 
 
364 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.49 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.9 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.53 
 
 
313 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.69 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  22.45 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  29.63 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  27.47 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  24.69 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  27.75 
 
 
352 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  29.27 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
338 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  26.74 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  25.96 
 
 
325 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  23.27 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  25.7 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  24.4 
 
 
211 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  22.99 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  24.64 
 
 
757 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  24.24 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.11 
 
 
588 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  20.26 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  24.49 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  25.73 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  19.3 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.6 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.46 
 
 
210 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>