87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1079 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
361 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.95 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.43 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.67 
 
 
369 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  28.69 
 
 
380 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.26 
 
 
371 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.12 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.03 
 
 
385 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  26.91 
 
 
386 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.09 
 
 
373 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  25.84 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.15 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.85 
 
 
363 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.35 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.97 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  25.36 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  26.56 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.19 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.61 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  23.41 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.63 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  27.18 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.78 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  32.09 
 
 
422 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
76 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
118 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 
100 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 
110 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  32.29 
 
 
119 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 
116 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
101 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.88 
 
 
98 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
95 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  22.99 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
100 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
101 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  38.2 
 
 
95 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
100 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 
94 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  38.81 
 
 
103 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  40.3 
 
 
96 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  37.76 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.31 
 
 
102 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  38.81 
 
 
101 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
104 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  32.89 
 
 
94 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 
95 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.96 
 
 
93 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  32.56 
 
 
120 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.56 
 
 
120 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  32.04 
 
 
319 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  32.56 
 
 
94 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5400  hypothetical protein  33.68 
 
 
355 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.84 
 
 
97 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 
100 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.82 
 
 
108 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  32.89 
 
 
96 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 
103 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2251  hypothetical protein  26.29 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116147  normal  0.0186362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 
117 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.26 
 
 
128 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.12 
 
 
96 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  31.68 
 
 
123 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
103 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 
101 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.14 
 
 
105 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.82 
 
 
99 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.71 
 
 
113 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  31.33 
 
 
131 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  31.71 
 
 
113 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  32.43 
 
 
99 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  31.33 
 
 
131 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.33 
 
 
131 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  31.33 
 
 
131 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  31.33 
 
 
131 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.33 
 
 
131 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 
106 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0634  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.93 
 
 
102 aa  42.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>