117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1026 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1099  xylose isomerase domain-containing protein  39.45 
 
 
293 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  39.24 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  39.24 
 
 
295 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  39.24 
 
 
295 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  32.3 
 
 
274 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  30.37 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.03 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4204  xylose isomerase domain-containing protein  27.6 
 
 
629 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 
635 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.65 
 
 
628 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.79 
 
 
630 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.79 
 
 
630 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.57 
 
 
638 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  25 
 
 
687 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.42 
 
 
630 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27 
 
 
630 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.67 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.46 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4755  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.6 
 
 
637 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304127  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5035  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.52 
 
 
632 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3913  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 
617 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.974395  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  35.71 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  29.46 
 
 
629 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  37.8 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4415  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.57 
 
 
628 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.57 
 
 
628 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.92924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  29.55 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4963  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.91 
 
 
630 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  31.51 
 
 
273 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3062  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.86 
 
 
630 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0782  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.25 
 
 
630 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.817905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.86 
 
 
630 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0122  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.66 
 
 
627 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  25.19 
 
 
626 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.32 
 
 
632 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0577  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
687 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0848  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1752  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2205  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0891  AP endonuclease  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.940921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1894  putative amino acid dioxygenase  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0481  AP endonuclease  25 
 
 
684 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.36 
 
 
627 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
631 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1777  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.29 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.4 
 
 
631 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  31.94 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0606  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.88 
 
 
624 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0633938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4428  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.36 
 
 
633 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.98 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.36 
 
 
624 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  27.07 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5449  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.95 
 
 
615 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  26.77 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3320  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.81 
 
 
630 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  31.82 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.95 
 
 
604 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.74 
 
 
615 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0882  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.52 
 
 
627 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1586  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.84 
 
 
621 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  30.11 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.64 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08170  hydroxypyruvate isomerase  29.58 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  23.39 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  23.77 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6113  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.64 
 
 
623 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1477  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.68 
 
 
596 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 
283 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  25.83 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.81 
 
 
635 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.66 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  27.86 
 
 
266 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  27.8 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  23.77 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.19 
 
 
635 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.19 
 
 
635 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  22.13 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  25.84 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  27.78 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  25.4 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  24.72 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  23.21 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  25.37 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.94 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2375  xylose isomerase-like TIM barrel  24.3 
 
 
477 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  27.45 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>