More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0978 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  81.27 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.5 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  57.98 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  57.77 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.87 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.29 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  48.69 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.94 
 
 		 320 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.08 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  47.81 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  49.18 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  49.18 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  54.82 
 
 		 200 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  46.18 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  45.75 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  45.75 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  45.75 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  46.5 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.04 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  44.53 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  44.94 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  44.94 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  45.08 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  43.85 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  42.21 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.5 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.39 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.25 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.5 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 231 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.7 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  39.09 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.71 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.11 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.93 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.49 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.26 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.2 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.27 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 229 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 237 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  38.37 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 227 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  35.2 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  34.57 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 227 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 228 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>