More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0945 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
149 aa  295  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  87.92 
 
 
149 aa  256  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  88.36 
 
 
149 aa  254  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  78.17 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  75.86 
 
 
154 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  60.77 
 
 
170 aa  147  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 
140 aa  140  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  40.8 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  38.71 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  38.33 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  35.16 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  34.11 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.46 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  32.43 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  33.96 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  41.18 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 
166 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  32.69 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  33.57 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
233 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  34.86 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
171 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  41.98 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.29 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  32.26 
 
 
171 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
194 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>