More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0944 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  100 
 
 
480 aa  950    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  64 
 
 
450 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  61.66 
 
 
482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  58.7 
 
 
480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  55.94 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  50.54 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  49.11 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  48.21 
 
 
480 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  48.92 
 
 
472 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  47.16 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  48.04 
 
 
475 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  46.15 
 
 
464 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  44.84 
 
 
473 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  44.62 
 
 
473 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.14 
 
 
480 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.89 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.34 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  38.77 
 
 
457 aa  303  6.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  37.01 
 
 
446 aa  293  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  37.99 
 
 
449 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.64 
 
 
468 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.15 
 
 
448 aa  283  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.56 
 
 
474 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  35.38 
 
 
480 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  37.69 
 
 
482 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.6 
 
 
452 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  36.38 
 
 
491 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.51 
 
 
484 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  39.19 
 
 
462 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  37.16 
 
 
468 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  33.97 
 
 
471 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  36.87 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  36.87 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  33.97 
 
 
471 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  33.97 
 
 
471 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  36.87 
 
 
472 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  36.87 
 
 
472 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  36.87 
 
 
472 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  36.87 
 
 
472 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  36.87 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  36.87 
 
 
472 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  36.64 
 
 
472 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  37.31 
 
 
472 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  37.31 
 
 
472 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  37.31 
 
 
472 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  37.31 
 
 
472 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  35.06 
 
 
466 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.48 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  36.74 
 
 
465 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  37.09 
 
 
472 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.48 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  35.35 
 
 
471 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  35.35 
 
 
482 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.91 
 
 
476 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  38.07 
 
 
464 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.39 
 
 
459 aa  261  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  38.31 
 
 
464 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.39 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  38.31 
 
 
464 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  38.34 
 
 
464 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  38.34 
 
 
464 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  38.34 
 
 
464 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  38.34 
 
 
464 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  38.34 
 
 
464 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  35.61 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.14 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.52 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  32.37 
 
 
468 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  34.49 
 
 
471 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.65 
 
 
507 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.31 
 
 
447 aa  249  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  33.05 
 
 
474 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  33.05 
 
 
509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  32.53 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  33.9 
 
 
467 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.63 
 
 
457 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.8 
 
 
458 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  32.39 
 
 
478 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.32 
 
 
516 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  33.79 
 
 
442 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.91 
 
 
437 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.77 
 
 
485 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  33.54 
 
 
499 aa  238  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.32 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.96 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  35.35 
 
 
480 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31.76 
 
 
497 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  33.62 
 
 
489 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  33.69 
 
 
470 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  33.48 
 
 
493 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  32.45 
 
 
486 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.31 
 
 
452 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.31 
 
 
452 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  32.81 
 
 
475 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>