37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0823 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1297    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  72.64 
 
 
659 aa  931    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  41.98 
 
 
651 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  28.7 
 
 
633 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  31.71 
 
 
603 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  33.28 
 
 
618 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  32.82 
 
 
770 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  35.96 
 
 
675 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  35.1 
 
 
584 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  33.56 
 
 
619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  30.08 
 
 
654 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  29.95 
 
 
624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  33.13 
 
 
692 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  32.15 
 
 
644 aa  210  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  33.12 
 
 
638 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  29.04 
 
 
673 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25 
 
 
623 aa  172  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.98 
 
 
867 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  35.17 
 
 
593 aa  150  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  27.51 
 
 
580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  28.36 
 
 
624 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  26.56 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.06 
 
 
615 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  24.07 
 
 
593 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  26.7 
 
 
742 aa  97.8  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  22.35 
 
 
580 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.73 
 
 
1072 aa  81.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  30.12 
 
 
474 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  25.82 
 
 
483 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.63 
 
 
482 aa  48.9  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
445 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  26.63 
 
 
580 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
455 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
480 aa  44.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  30 
 
 
473 aa  44.3  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.11 
 
 
506 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>