More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0807 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  31.77 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  33.93 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.9 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  29.77 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  31.33 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 375 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  29.41 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  27.78 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  30.92 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  25.43 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  25.08 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  25.65 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  25.27 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>