More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0804 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
246 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  93.9 
 
 
246 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.8 
 
 
273 aa  335  3e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.75 
 
 
243 aa  326  2e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  66.67 
 
 
236 aa  324  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.96 
 
 
254 aa  324  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  62 
 
 
406 aa  318  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.53 
 
 
242 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  62.9 
 
 
248 aa  315  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.25 
 
 
271 aa  315  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  62.1 
 
 
252 aa  310  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  66.08 
 
 
231 aa  299  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.57 
 
 
252 aa  298  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  63.79 
 
 
254 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  63.79 
 
 
254 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  63.79 
 
 
254 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  61.48 
 
 
286 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  61.04 
 
 
250 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  64.81 
 
 
249 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
255 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  53.91 
 
 
257 aa  268  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.67 
 
 
239 aa  258  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 
237 aa  258  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 
244 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 
231 aa  253  2e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
242 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 
240 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.65 
 
 
236 aa  244  7e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 
233 aa  243  2e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.36 
 
 
238 aa  242  4e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  54.02 
 
 
233 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 
248 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.78 
 
 
243 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
235 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  49.17 
 
 
241 aa  238  6e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.48 
 
 
244 aa  238  6e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.91 
 
 
239 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 
236 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 
238 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  50 
 
 
246 aa  235  5e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
236 aa  235  5e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  54.46 
 
 
233 aa  234  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.51 
 
 
239 aa  234  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 
233 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 
237 aa  233  2e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  50.63 
 
 
243 aa  229  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 
242 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  52.04 
 
 
234 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 
239 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 
236 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  49.78 
 
 
247 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  49.56 
 
 
235 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 
241 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  49.13 
 
 
246 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
229 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 
236 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
229 aa  220  2e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
230 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
234 aa  213  3e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  47.51 
 
 
251 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
241 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 
270 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
252 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 
258 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
239 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
227 aa  205  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
240 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
236 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
231 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 
224 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
230 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
230 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
230 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
231 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 
224 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.95 
 
 
241 aa  197  1e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45 
 
 
228 aa  196  2e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
225 aa  195  5e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 
225 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.01655e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
224 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.3 
 
 
230 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
228 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
224 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
256 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
225 aa  189  3e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
227 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
237 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.99 
 
 
227 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 
223 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
223 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 
225 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  2.06018e-08 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 
227 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
244 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 
246 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.22 
 
 
229 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 
245 aa  184  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
224 aa  184  1e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>