More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0776 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
488 aa  934    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.76 
 
 
514 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.15 
 
 
487 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.25 
 
 
519 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.57 
 
 
509 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.94 
 
 
788 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.93 
 
 
500 aa  342  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.67 
 
 
475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.17 
 
 
505 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.01 
 
 
512 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.2 
 
 
508 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.02 
 
 
499 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.82 
 
 
498 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
501 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.03 
 
 
503 aa  296  8e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.35 
 
 
499 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.18 
 
 
487 aa  292  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 
499 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.1 
 
 
498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 
486 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 
487 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.66 
 
 
490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  40.3 
 
 
492 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.69 
 
 
763 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 
470 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
527 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.18 
 
 
493 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  44.44 
 
 
482 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.7 
 
 
519 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
491 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.23 
 
 
501 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.03 
 
 
519 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.82 
 
 
488 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.05 
 
 
470 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.33 
 
 
481 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 
553 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 
474 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
478 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
487 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 
490 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 
530 aa  236  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.1 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 
757 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
469 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
733 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  35.19 
 
 
529 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  35.19 
 
 
529 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  35.19 
 
 
529 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 
489 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 
543 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  41.34 
 
 
505 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  35.38 
 
 
508 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.61 
 
 
507 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  34.91 
 
 
543 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 
528 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  37.8 
 
 
454 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 
482 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.66 
 
 
482 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.91 
 
 
522 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  36.8 
 
 
475 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.98 
 
 
502 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  34.51 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 
539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.5 
 
 
497 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 
522 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 
583 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 
479 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
520 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.15 
 
 
496 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  33.05 
 
 
530 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.73 
 
 
498 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 
482 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 
482 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 
479 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.6 
 
 
530 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  34.9 
 
 
492 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  35.96 
 
 
477 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.82 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
540 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 
1112 aa  200  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 
487 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
492 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.25 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.89 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>