More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0520 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  46.86 
 
 
878 aa  677    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.44 
 
 
858 aa  706    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  49.18 
 
 
847 aa  738    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  69.29 
 
 
845 aa  1091    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  46.62 
 
 
816 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  51.12 
 
 
852 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
828 aa  1680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  44.82 
 
 
831 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  44.3 
 
 
759 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  44.14 
 
 
758 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  44.14 
 
 
758 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  44.14 
 
 
758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  43.42 
 
 
763 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.31 
 
 
797 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.96 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  41.57 
 
 
766 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  40.11 
 
 
495 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  40.15 
 
 
477 aa  310  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  37.91 
 
 
815 aa  297  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  38.62 
 
 
847 aa  294  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  34.93 
 
 
902 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  36.48 
 
 
864 aa  287  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  35.83 
 
 
882 aa  281  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  34.86 
 
 
877 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  34.77 
 
 
815 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  36.77 
 
 
867 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  35.91 
 
 
863 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  35.52 
 
 
853 aa  269  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  32.8 
 
 
896 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  35.22 
 
 
901 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  35.62 
 
 
846 aa  263  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  35.25 
 
 
534 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  36.08 
 
 
837 aa  260  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  32.29 
 
 
855 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.37 
 
 
845 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  33.81 
 
 
872 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  35.1 
 
 
851 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  34.62 
 
 
833 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.52 
 
 
871 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  35.21 
 
 
840 aa  254  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  34.12 
 
 
847 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  35.56 
 
 
871 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  37.75 
 
 
896 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  34.82 
 
 
833 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  34.69 
 
 
832 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.79 
 
 
861 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  32.82 
 
 
818 aa  250  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  32.36 
 
 
900 aa  250  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  34.07 
 
 
837 aa  248  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  37.27 
 
 
436 aa  248  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  34.81 
 
 
833 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  34.06 
 
 
834 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.27 
 
 
303 aa  244  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  32.32 
 
 
813 aa  244  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.31 
 
 
825 aa  244  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  34.34 
 
 
927 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  32.43 
 
 
843 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  34.06 
 
 
932 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  45.55 
 
 
304 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  33.83 
 
 
866 aa  240  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  33.27 
 
 
848 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.83 
 
 
822 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  31.85 
 
 
882 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  32.06 
 
 
895 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  33.94 
 
 
949 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  33.92 
 
 
927 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  44.41 
 
 
305 aa  237  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  32.39 
 
 
883 aa  235  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.26 
 
 
865 aa  234  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  32.45 
 
 
856 aa  234  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  43.24 
 
 
302 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  33.73 
 
 
936 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  43.24 
 
 
303 aa  232  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  42.56 
 
 
302 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  33.56 
 
 
936 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  31.68 
 
 
881 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  31.51 
 
 
940 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  33.27 
 
 
825 aa  227  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  34.39 
 
 
868 aa  227  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  34.39 
 
 
868 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  45.39 
 
 
321 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  45.3 
 
 
293 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  41.81 
 
 
352 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  31.26 
 
 
886 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  30.97 
 
 
888 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  32.21 
 
 
845 aa  221  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  31.47 
 
 
893 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  34.83 
 
 
846 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.36 
 
 
292 aa  217  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  31.16 
 
 
914 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  32.73 
 
 
837 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  29.5 
 
 
866 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  39.13 
 
 
306 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.38 
 
 
302 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  38.37 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  42.45 
 
 
316 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  30.48 
 
 
817 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  38.7 
 
 
351 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  36.58 
 
 
603 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  36.25 
 
 
646 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>