216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0492 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  79.08 
 
 		 301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  54.93 
 
 		 297 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  52.38 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  45.94 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  45.74 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  44.48 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  45.36 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  47.04 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  46.38 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  47.16 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  42.33 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  45.49 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  40.89 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  43.2 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  43.82 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.07 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  41.49 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  42.71 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  44.49 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  41.34 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  44.73 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  46.82 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  40.64 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  41.96 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  43.07 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  44.56 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  43.53 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  43.62 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  43 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  43.43 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  42.64 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  39.03 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  45.13 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  41.5 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.58 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  40.61 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  41.42 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  44.1 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  42.91 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.48 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  41.28 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.77 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  37.38 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.81 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  41.58 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  36.4 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  39.45 
 
 		 258 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.15 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  39.26 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41.35 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.17 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  41.2 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.64 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.09 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.25 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  40.93 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.6 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>