225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0465 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
261 aa  514  1e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
257 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.59 
 
 
258 aa  245  5e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
254 aa  238  6e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
254 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
255 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 
256 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 
256 aa  231  8e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 
255 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 
255 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
252 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  47.84 
 
 
256 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  42.75 
 
 
255 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
255 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 
256 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
254 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
253 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
260 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
254 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  46.83 
 
 
260 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
260 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 
253 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46 
 
 
255 aa  222  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 
255 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
260 aa  221  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
253 aa  221  1e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
253 aa  220  1e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
255 aa  220  2e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 
256 aa  220  2e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 
253 aa  220  2e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  48.43 
 
 
257 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 
253 aa  219  4e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 
253 aa  219  4e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 
253 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
254 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
253 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.29 
 
 
255 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  48.83 
 
 
262 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 
253 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 
253 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
257 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 
256 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
254 aa  215  6e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 
254 aa  215  6e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 
274 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 
256 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
256 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 
255 aa  214  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 
254 aa  214  1e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 
254 aa  213  2e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 
256 aa  213  3e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 
252 aa  211  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  47.43 
 
 
255 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
251 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 
257 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 
256 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
252 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  48.64 
 
 
258 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  47.84 
 
 
304 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 
245 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
252 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 
250 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  48.37 
 
 
258 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 
250 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
266 aa  205  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
301 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.8 
 
 
253 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.01 
 
 
255 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
249 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 
255 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  45.16 
 
 
254 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 
255 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 
256 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
244 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
251 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.22 
 
 
252 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 
251 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 
255 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 
299 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  42.41 
 
 
258 aa  201  1e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  48.57 
 
 
251 aa  200  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 
253 aa  200  2e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
255 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
244 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
250 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
250 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 
250 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
250 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 
255 aa  199  4e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 
250 aa  199  4e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  45.53 
 
 
244 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
244 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 
244 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>