More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0421 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
419 aa  862    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  48.89 
 
 
413 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  47.45 
 
 
447 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  47.03 
 
 
411 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  44.8 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 
437 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  41.65 
 
 
439 aa  329  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 
443 aa  328  9e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  44.28 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  42.96 
 
 
388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  28.94 
 
 
418 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 
431 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.88 
 
 
417 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
431 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  30.8 
 
 
432 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  33.48 
 
 
450 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  33.48 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.18 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  30.13 
 
 
446 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  33.64 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  33.94 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  30.82 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  30.47 
 
 
446 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
442 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  31.03 
 
 
471 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  31.52 
 
 
455 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  33.48 
 
 
482 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
399 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  32.7 
 
 
472 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.45 
 
 
482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.15 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.21 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  32.48 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  30.98 
 
 
457 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  30.54 
 
 
457 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.19 
 
 
444 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  31.4 
 
 
454 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  32.75 
 
 
470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  30.75 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  33.71 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.94 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.96 
 
 
474 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.37 
 
 
472 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.8 
 
 
484 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  31.18 
 
 
447 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  31.87 
 
 
436 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.19 
 
 
458 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  30.7 
 
 
457 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  31.07 
 
 
451 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.22 
 
 
478 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  32.41 
 
 
435 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  31.1 
 
 
463 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.46 
 
 
462 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  29.98 
 
 
474 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  31.18 
 
 
444 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.25 
 
 
427 aa  176  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  31.55 
 
 
472 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.28 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  30.9 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  30.65 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  28.39 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  31.64 
 
 
440 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30.75 
 
 
439 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.87 
 
 
459 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  31.28 
 
 
453 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  31.74 
 
 
440 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.83 
 
 
478 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  29.25 
 
 
467 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  31.18 
 
 
457 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
487 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
478 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  30.14 
 
 
448 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  31.71 
 
 
447 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  29.95 
 
 
448 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
427 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  31.99 
 
 
436 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  32.83 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.36 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  29.74 
 
 
494 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  29.3 
 
 
468 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  30.74 
 
 
453 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  31.28 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  29.68 
 
 
450 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  29.77 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  27.95 
 
 
909 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  29.31 
 
 
467 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  28.54 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  32.67 
 
 
455 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  29.4 
 
 
488 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  29.3 
 
 
451 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  31.89 
 
 
466 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  28.51 
 
 
478 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  28.41 
 
 
451 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  29.66 
 
 
458 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
470 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
443 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  30.46 
 
 
467 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  30.47 
 
 
485 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
452 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.85 
 
 
468 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>