More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0371 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 339 aa  678    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  77.38 
 
 		 351 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  53.85 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  51.96 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  52.23 
 
 		 372 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  51.65 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  52.73 
 
 		 333 aa  311  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  50.61 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  44.61 
 
 		 335 aa  291  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  48.3 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  49.02 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  48.64 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  46.71 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  46.94 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  50.76 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  48.66 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  47.38 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  47.59 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  46.78 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  43.75 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  41.84 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  42.81 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  41.69 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 340 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  43.64 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  43.2 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  41.85 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  41.95 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  39.09 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  38.21 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  43.95 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  39.46 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.77 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  39.02 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  38.18 
 
 		 360 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  37.88 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  37.88 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  37.88 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  37.88 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  37.58 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  37.88 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  37.72 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  38.11 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  42.82 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  39.21 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.76 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.88 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  35.61 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  37.24 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.24 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  35.89 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  35.12 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  38.85 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  35.12 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  35.12 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  35.2 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.95 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.64 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.15 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.72 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  35.35 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.64 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.24 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  34.91 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  34.24 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  34.24 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.94 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.94 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>